also ich kann aus eigener Erfahrung sagen, dass die 48V Batterie die 12V Batterie automatisch nachlädt, wenn diese schwach wird. Hatte die Haube auf (48V getrennt durch Relais) und hab die 12V fast leergedudelt. Nachdem die Haube zu gewesen ist, war nach ein paar Stunden wieder volle Spannung auf der 12V Batterie und auch sämtliche Meldungen, dass man den Motor starten muss verschwunden. Wie lange dieser Vorgang allerdings technisch genau dauert hab ich nicht nachgemessen.
EDIT: Jetzt wo ich drüber nachdenke macht das ja auch total Sinn. Es gibt ja nur eine 48V Lichtmaschine und nicht jeweils eine für 48V und 12V. Das heißt es wird so oder so immer die 12V Batterie "über" die 48V Batterie geladen.